在使用集装箱活动房时，常见问题是在运输过程中有障碍物刮擦集装箱房屋表面的保护层，这样后期集装箱活动房很容易被锈蚀，集装箱房屋的整体生命周期也会被减少。因此，有必要注意在运输过程中可能遇到的一些障碍。
当不使用集装箱活动房时，应该注意哪些问题才能促进集装箱活动房的使用?首先，集装箱活动房的破坏式阳光暴晒，太阳每天直接直射，对集装箱活动房的保护层是一种较大的伤害，因此在储存集装箱房时应注意使用遮阳伞。同样，下雨时，还必须采取防雨措施。
在使用集装箱活动房时，必须要有防火和防水设置。目前火灾在建筑工地中很常见，如果集装箱活动房使用的是泡沫彩钢板，防火问题更是不容忽视。随着环保工作的推进，泡沫彩钢板做的集装箱房逐渐退出市场，岩棉阻燃板做的集装箱活动房成为市场的主流。