对于招标审计来说，由于工程施工招投标审计为事后审计， 加上违规手段隐蔽， 往往存在较大审计风险， 在审计过程中应更加注重审计程序到位，掌握招投标审计的重点和方法。 注意审查招标过程中有无人为的压价、哄抬标价或泄露标底的现象，审计人员可以通过查阅比对标底和各家投标单位的投标文件来发现其中的端倪。
招标文件审计，主要审计招标文件中的投标报价要求、评标标准和方法、进度款付款办法、计价取费依据、结算办法、合同主要条款、技术条款、竣工验收后保修工作的措施和承诺以及违约责任等内容。关注是否存在招标人以不合理的标段或工期限制或者排斥潜在投标人或者投标人的现象。
标底文件审计，重点审计报告编制标底依据的招标文件、设计图纸及有关资料是否合法有效；是否由相应执业资质的工程造价专业人员来编制标底；工程量清单的计算、套用定额是否严格按施工图和国家定额的有关规定，编制标底是否合理，是否控制在设计概算以内，有无人为调整标底问题。
建设工程项目招投标专业性强、涵盖面广、体系庞杂，审查工作包括查看招投标文件、现场签到表等相关书面资料，将同一项目不同投标单位的投标文件进行对比，将不同时间段或不同项目的表述进行对比，利用互联网进行各投标单位相关资料查询等：
利用互联网进行各投标单位相关资料查询(例如核实联系电话、公司名称等，可能会发现不同公司联系人号码相同、公司信息有相关性等等问题)、查工商注册资料(例如通过相关机构查询公司股东构成等资料，可能存在不同公司具有相同关联人信息的现象)、查人(例如针对同一个人进行地毯式调查，可能会发现同一人与其他投标单位的内在关系)；对相关工程材料设备等进行询价比对，了解投标单位报价的合理性。
标书制作流程
1.准备阶段：确认招标信息，收集相关材料，制定标书制作计划并分配任务。
2.编写阶段：根据招标文件要求编写标书内容，包括技术方案、工程量清单、施工组织设计等，要注意排版、文字规范、格式统一等。
3.审查阶段：审核标书内容是否符合招标文件要求、是否充分体现企业实力和竞争优势，检查文案、语言是否恰当、错别字是否纠正等。
4.修改阶段：根据审查意见对标书内容进行修改完善，增加内容的可读性和竞争力。
5.印刷阶段：在规定的时间内将标书提交至招标人处，要注意标书格式、封面设计等。