医院目前有沈河、和平、北陵3个院区和4个派驻门诊部。沈河院区主要承载师以上首长救治、学术交流、战救及临床技能培训任务，是全院各院区医疗救治的总依托。和平院区主要承载科研教学、卫勤战备、专科患者救治，是军事医学研发、军地两用人才培训的重要平台。北陵院区主要开设康复医学科，负责伤病员术后康复任务。派驻门诊部主要承担战区机关、各军兵种、省军区等服务保障任务。各点位相对独立，又交叉融合，功能互补，形成了资源整合、功能耦合、发展聚合的部署格局。
作为“全国健康咨询及就医指导平台”的官方网站，挂号网通过号源托管、HIS直连、搜索链接三种方式聚合了全国超过400家重点三级医院的预约挂号资源，建立了全国三级医院22万名医生的专长库，帮助全国用户“找对医生挂到号”。
“全国健康咨询及就医指导平台”启动两年来，已成功为全国超过1200万用户提供了预约挂号、就医指导、健康咨询服务，成为了全国规模的医疗健康服务平台。
2018年7月1日，黑龙江省卫生计生委发出通知，要求全省各级医疗机构均实行实名制挂号就诊。
导医陪诊：提供专业就诊指导，提前预约专家、预约检查等，医院内全程陪同，并解决异地就医食宿出行问题。 预约挂号：看病就医，预约指定专家号，三甲医院数千专家任您选择。
当用户在医院预约挂号系统预约挂号并确认成功以后，请携带本人有效证件，在预约时间当天准时到预约的医院门诊挂号处核对预约信息后，按照医院正常流程进行取号，因就医病人多，过时号额不予保留。
用户可直接替本人挂号，也可替家人或朋友挂号，但必须携带就诊者的身份证件或有效证件。没有相关身份证明的儿童预约挂号，请在预约单确认时填写同儿童一起到医院的监护人的真实姓名和身份证号。